Site actif

Cette sous-section de la section Fonction est utilisée pour les enzymes et indique les résidus directement impliqués dans la catalyse.

Exemple : Q9F6D4

Lorsque le rôle exact d’un résidu du site actif est connu, il est indiqué à l’aide d’un vocabulaire semi-contrôlé dans le champ ‘Description’. Les rôles possibles sont :

• Système de relais de charge
• Electrophile
• Nucléophile
• Donneur de protons
• Accepteur de protons

Exemple : Q9ZTP5

Dans le cas de polyprotéines virales ou d’enzymes multifonctionnelles, le nom de l’activité enzymatique spécifique impliquant le résidu « site actif » est indiqué dans le champ « Description ».
Exemple : P12276

Les nucléophiles donnent lieu à des intermédiaires covalents de courte durée. Dans la mesure du possible, nous indiquons la nature chimique exacte de l’intermédiaire, en utilisant un vocabulaire semi-contrôlé.
Exemple : P27796

Chaque sous-section ‘Site actif’ fait référence à un seul acide aminé. Il peut y avoir une ou plusieurs sous-sections ‘Site actif’, selon la nature du mécanisme catalytique.

Lorsque l’activité catalytique est apportée par des ions métalliques ou des molécules d’eau liés, ou par un contact direct entre le substrat et le cofacteur, nous n’ajoutons aucune sous-section ‘Site actif’.