Sito attivo

Questa sottosezione della sezione Function è usata per gli enzimi e indica i residui direttamente coinvolti nella catalisi.

Esempio: Q9F6D4

Quando il ruolo esatto di un residuo del sito attivo è noto, questo è indicato usando un vocabolario semi-controllato nel campo ‘Descrizione’. I ruoli possibili sono:

• Relatore di carica
• Elettrofilo
• Nucleofilo
• Donatore di protoni
• Accettore di protoni

Esempio: Q9ZTP5

Nel caso di poliproteine virali o enzimi multifunzionali, il nome della specifica attività enzimatica che coinvolge il residuo del ‘sito attivo’ è indicato nel campo ‘Descrizione’.
Esempio: P12276

I nucleofili danno origine a intermedi covalenti di breve durata. Quando possibile, indichiamo l’esatta natura chimica dell’intermedio, usando un vocabolario semi-controllato.
Esempio: P27796

Ogni sottosezione “Sito attivo” si riferisce ad un singolo amminoacido. Ci possono essere una o più sottosezioni ‘Sito attivo’, a seconda della natura del meccanismo catalitico.

Quando l’attività catalitica è determinata da ioni metallici legati o molecole d’acqua, o dal contatto diretto tra substrato e cofattore, non aggiungiamo alcuna sottosezione ‘Sito attivo’.