7.2A: Chromosomy bakteryjne w nukleoidzie
Nukleoid
Nukleoid (co oznacza podobny do jądra) jest regionem o nieregularnym kształcie wewnątrz komórki prokariota, który zawiera cały lub większość materiału genetycznego. W przeciwieństwie do jądra komórki eukariotycznej, nie jest on otoczony błoną jądrową. Genom organizmów prokariotycznych jest na ogół kolistym, dwuniciowym fragmentem DNA, którego wiele kopii może istnieć w dowolnym momencie. Długość genomu jest bardzo różna, ale na ogół wynosi co najmniej kilka milionów par zasad.
Nukleoid może być wyraźnie widoczny na mikrografie elektronowym w dużym powiększeniu, gdzie jest wyraźnie widoczny na tle cytozolu. Czasami widoczne są nawet pasma tego, co uważa się za DNA. Nukleoid może być również widoczny w mikroskopie świetlnym, poprzez barwienie go barwnikiem Feulgena, który specyficznie barwi DNA. Barwniki interkalujące DNA DAPI i bromek etydyny są szeroko stosowane w mikroskopii fluorescencyjnej nukleoidów.
Dowody doświadczalne sugerują, że nukleoid składa się w dużej mierze z około 60% DNA, plus niewielka ilość RNA i białka. Te dwa ostatnie składniki to prawdopodobnie głównie RNA posłańca i białka czynnika transkrypcyjnego, które regulują genom bakterii. Białka, które pomagają w utrzymaniu struktury superzwiniętego kwasu nukleinowego są znane jako białka nukleoidu lub białka związane z nukleoidem i różnią się od histonów jąder eukariotycznych. W przeciwieństwie do histonów, białka wiążące DNA w nukleoidzie nie tworzą nukleosomów, w których DNA jest owinięte wokół rdzenia białkowego. Zamiast tego, białka te często wykorzystują inne mechanizmy, takie jak pętle DNA, aby promować zagęszczanie.