Sitio activo
Esta subsección de la sección Función se utiliza para las enzimas e indica los residuos que participan directamente en la catálisis.
Ejemplo: Q9F6D4
Cuando se conoce el papel exacto de un residuo del sitio activo, éste se indica utilizando un vocabulario semicontrolado en el campo ‘Descripción’. Los posibles roles son:
- Sistema de relevo de carga
- Electrofilo
- Nucleófilo
- Donante de protones
- Aceptor de protones
Ejemplo: Q9ZTP5
En el caso de las poliproteínas virales o de las enzimas multifuncionales, el nombre de la actividad enzimática específica en la que interviene el residuo del «sitio activo» se indica en el campo «Descripción».
Ejemplo: P12276
Los nucleófilos dan lugar a intermediarios covalentes de corta duración. Siempre que sea posible, indicamos la naturaleza química exacta del intermediario, utilizando un vocabulario semicontrolado.
Ejemplo: P27796
Cada subsección «Sitio activo» se refiere a un solo aminoácido. Puede haber una o varias subsecciones de ‘Sitio activo’, dependiendo de la naturaleza del mecanismo catalítico.
Cuando la actividad catalítica se produce por iones metálicos unidos o moléculas de agua, o por contacto directo entre el sustrato y el cofactor, no añadimos ninguna subsección de ‘Sitio activo’.