Miejsce aktywne
Ta podsekcja sekcji Funkcja jest używana dla enzymów i wskazuje reszty bezpośrednio zaangażowane w katalizę.
Przykład: Q9F6D4
Gdy znana jest dokładna rola reszty w miejscu aktywnym, jest ona wskazywana przy użyciu półkontrolowanego słownictwa w polu „Opis”. Możliwe role to:
- System przekaźnika ładunku
- Elektrofil
- Nukleofil
- Dawca protonu
- Akceptor protonu
Przykład: Q9ZTP5
W przypadku poliprotein wirusowych lub enzymów wielofunkcyjnych, w polu „Opis” podaje się nazwę konkretnej aktywności enzymatycznej z udziałem reszty „miejsca aktywnego”.
Przykład: P12276
Nukleofile powodują powstanie krótkotrwałych kowalencyjnych intermediatów. Gdy tylko jest to możliwe, podajemy dokładną chemiczną naturę tego intermediatu, używając słownictwa częściowo kontrolowanego.
Przykład: P27796
Każdy podrozdział „Miejsce aktywne” odnosi się do pojedynczego aminokwasu. Może istnieć jedna lub kilka podsekcji „Miejsce aktywne”, w zależności od charakteru mechanizmu katalitycznego.
Gdy aktywność katalityczna jest wywoływana przez związane jony metali lub cząsteczki wody, lub przez bezpośredni kontakt substratu i kofaktora, nie dodajemy żadnej podsekcji „Miejsce aktywne”.