Site activo
Esta subsecção da secção Função é usada para enzimas e indica os resíduos directamente envolvidos na catálise.
Exemplo: Q9F6D4
Quando o papel exacto de um resíduo de sítio activo é conhecido, isto é indicado utilizando um vocabulário semi-controlado no campo ‘Descrição’. Os papéis possíveis são:
- Sistema de relé de carga
- Electrophile
- Nucleófilo
- Doador de botão
- Receptor de botão
Exemplo: Q9ZTP5
No caso de poliproteínas virais ou enzimas multifuncionais, o nome da actividade enzimática específica envolvendo o resíduo ‘local activo’ é indicado no campo ‘Descrição’.
Exemplo: P12276
Nucleófilos dão origem a intermediários covalentes de curta duração. Sempre que possível, indicamos a natureza química exacta do intermediário, utilizando um vocabulário semi-controlado.
Exemplo: P27796
Cada subsecção “Sítio activo” refere-se a um único aminoácido. Pode haver uma ou várias subsecções ‘Local activo’, dependendo da natureza do mecanismo catalítico.
Quando a actividade catalítica é provocada por iões metálicos ligados ou moléculas de água, ou por contacto directo entre o substrato e o cofactor, não adicionamos nenhuma subsecção ‘Local activo’.